Toyota 4runner, 3VZE

[Pin]

Зажигание настроено по стробоскопу, сам настраивал. Метка на шкиву и на самой шестерне совпадает, проверил. С углом зажигания и с метками грм всё в порядке

Так я о том и пишу , что если зажигание настроили по стробоскопу и при этом трамблер вывернут почти до упора - это первый признак неверной установки меток или самого трамблера. Если все стоит верно - крепеж трамблера ровно посередине уха, регулировка зажигания - смещение трамблера буквально на 2-3мм от этого положения.

Чудес не бывает - сделайте лог без сапуна , если будут аналогичные пульсации, то придется искать причину почему трамблер отвернут почти до упора.
Других вариантов нет.
При снятии лога дополнительно установите перемычку между выходом сигнала с конвертера и входом TPS/VAF конвертера.

если можете самостоятельно собрать датчик пульсаций разряжения и снять осциллограмму через звуковую карту - можно снять пульсации разряжения , по ним видно будет , что с ГРМ реально творится.

п.с. На старых трамблера бывало шестерную проворачивало , или ее криво ставили при разборке. Но у вас вроде новый трамблер - с коротким валом, и на них , если я не ошибаюсь, шестерня зафиксирована шплинтом.